Foreningen har 17 lokale kredse i landet. Kredsene har hver sin kredsbestyrelse, der gør et stort frivilligt arbejde, blandt andet med at arrangere faglige og sociale arrangementer.

Kredsbestyrelserne udgør tilsammen PTU's repræsentantskab, der træder sammen én gang årligt. Her træffes de helt overordnede beslutninger, og der vælges medlemmer til PTU's hovedbestyrelse, der sammen med PTU's direktør driver foreningens sekretariat og PTU's RehabiliteringsCenter.